Egy 16 éves John Kerig nevű srácot szinte mindenki utálja a suliban. Illetve...mindenhol utálják: emberek az utcán, a suliban az osztály, a boltos...mindenki. Egyik este egy szamuráj szólítja meg az utcán és azt mondja, hogy nemsokára el jön az idő. Aztán eltűnt. A fiú ezentúl mindig azon gondolkodott, hogy vajon mire akart utalni az a szamuráj. Másik nap újra megjelent és azt mondta, hogy tarts ki már nem sok idő kell. A fiúnak kezdtek furcsa látomásai lenni és valami gyökeresen megváltozott: egyik nap utálták, másik nap meg "királyként" kezelték. Két hét múlva újra találkozik a szamurájjal.
- Eljött az idő. Valóban benned van.
- Mi van bennem?
Következő nap a fiú arra ébredt, hogy valaki őrzi őt. Az pedig a szamuráj volt.
- Megfizettek tetteikért...teljesítettem ami legjobban aggasztott, most te is teljesítsd amit én kérek.
Ezzel megkezdődött az igazi harc.
Harcolnia kellett a fiúnak, ugyanis ő az Ősi Szent Főmesterek egyik reinkarnációja. Kiküldtek 13 szamurájt az ő megkeresésére. Ebből 12 engedelmeskedett. Viszont aki megtalálta ő a 13. szamuráj. El akarja venni az erejét. A fiú ezt még nem tudja, de rátalál a többi szamuráj is és kezdődik az igaz csata. 7 szamuráj útja során meghalt.

John Kerig:
Hatalmas erő van benne, ő az Ősi Szent Főmesterek egyik reinkarnációja. Olyan erővel rendelkezik, amiről ember még álmodni sem mer.

David Larre:
Ő a 13. szamuráj, aki nem a parancsot teljesíti. Meg akarja szerezni John erejét.

Kai Ganen:
Ő a 2 szamuráj. Ő viszi el John-t, a parancs feladójához. Van egy másik alakja is, melyet Kaito-nak nevez. A másik alakja őrült és még a Pokolnál is rosszabb.

Leros Ganen:
Ő Kai apja. Segít John-nak és Kai-nak a parancs teljesítésében.

Nukon Dia:
Ő a 12. szamuráj. Azt hiszi magáról, hogy erős és legyőzhetetlen. Ez nem igaz, gyenge, lusta.

Lan Seros:
Ő a 3. szamuráj. Ritka és furcsa neve van. Ezzel csak Dia szokta csúfolni. Segít John-nak és Kai-nak.

Eron Veras
Ő az 1. szamuráj. Mindig mindent többször is átgondol.

Rondo Fers:
Ő az 5. szamuráj. Nem nagyon akciózik. Inkább figyeli az eseményeket. Egyszer viszont segít John-nak.

Morfon:
Ő az első lény, aki mutáns. Segít Kai apjának legyőzni a vérfarkasokat.

Muranios:
Ő nagy hatalommal bíró mutáns. Ő írányítja a vérfarkasokat. Majdnem megöli Kai-t.

Serious:
Ő ejti csapdába Kai apját és Morfon-t. Hatalmas és erős szörny.

Keraga:
Ő a földből nő ki, olyan mint egy gyökérzet, csak a földből kinőtt.

Longa:
Ő ember, de félig transzformálódott. Egy nagy őrült eltörte John bordáit.

Varos:
Apró kicsi lény mely be megy a fülön keresztül és irányítja az embert.

Vérfarkas:
A vérfarkasok egyik része John-nak segít, másik nem.

Koroma:
Hatalmas szörny, utoljára kell megharcolniuk vele.

Ördög:
Ő szereti a vért. Koroma legyőzésénél segít Kai-nak és John-nak.

Persze, hogy megmutatja! Második szintre amúgy nem lép, de a Shikai-on lesz három jó képessége.